Da bi riješio sukob dvojice protupapa, Teodora i Paskala, rimski kler izabire za papu Sergija. Pod bizantskim utjecajem u njegovo se vrijeme u Rimu uvode blagdani: Uzvišenje sv. Križa, Svjećnica, Blagovijest, Velika i Mala Gospa. Sergije je odbio potpisati zaključke drugoga Trullskoga sabora (692.). koji je htio rimskoj Crkvi nametnuti istočno kanonsko pravo.
Car Justinijan ga osudi na smrt, ali ga zaštiti carska vojska. To je početak jačanja utjecaja papa na račun bizantskog cara.
Pape se sve više oslanjaju na franačke careve. Papa Sergije I. je u svetu misu uveo: "Agnus Dei – Jaganjče Božji" što se i danas moli.